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看看VNTI到底能帮我们干些什么
作者:sharpstone 整理时间:2005-09-05

最近有些时间, 想给大家探讨一下VNTI的功能。我先介绍几个项目 (每周一个),然后听听大家的看法。如果有兄弟想借此比较一下其它软件,自然是热烈欢迎。

几个项目是:

1。 让VNTI优化你的电泳条件

说实在的,电泳条件不需要优化,胡乱跑跑就行了。但如果要分离的片段靠得很近,当你发表文章需要漂亮结果,当你决定选什么条件过夜电泳能得到最大分辨率而又不跑出去时,电泳的优化就成了必须。VNTI会告诉你怎么办。


2。 用VNTI去研究你发现的新基因


3。 让VNTI找出EXON-INTRON的分界线


4。 用VNTI作出漂亮的质粒图 (无论有无序列)


5。 其它 (如果有时间)


好了, 开始:


1。 让VNTI优化你的电泳条件

VNTI模拟电泳包括:制胶,酶切,上样 (包括MARKER)及电泳四步。每一步任意设置条件,可以在12秒模拟3小时的电泳.

a) make a gel:

奇怪了, 才上传一个图, 上传的TOOBAR就已经不见了。难道H和A兄认为我太占地方 (玩笑)?

只能等等看了。


此主题相关图片如下:

接着谈VNTI的模拟电泳。 因为中文不能放在图上,只好手写。见谅:


此主题相关图片如下:


此主题相关图片如下:

这样,只要大家改改想优化的条件,就可以做到心中有数了。

发贴心情 看看VNTI到底能帮我们干些什么-3
图3

此主题相关图片如下:

做蛋白的人是乎不少,看看VNTI能否帮帮你:


此主题相关图片如下:

从51个分析项目中选择所需,转至下栏


此主题相关图片如下:


此主题相关图片如下:

曾经答应的。 在江湖里靠的是个“信”字,尽管它并不值多少钱。 闲话少叙,那些做新基因的看看VNTI能否帮你预测你的基因功能。

当然要先将DNA翻译成蛋白了,然后用VNTI打开:


此主题相关图片如下:

再两击鼠标,功能域及其功能特点就显示出来了:


此主题相关图片如下:

假期就要完了,喝着咖啡和兄弟们聊天的日子也要结束了。再贴上一贴,就算为我曾说的话画上个句号。另外我的半身的照片已贴到“灌水区”,不过。。。。

画质粒图的软件很多了,可能没有多少人会想起来VNTI。其实用VNTI制图很方便。因为质粒都大同小异,作好一个,然后稍微修改一下就是另一个图了。

首先建立一个新的DNA序列,remove所有的 “feature and restriction sites", 然后:


此主题相关图片如下:

这样就可以在图上(而不依赖序列)直接作图了


此主题相关图片如下:
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然后给画上的基因和片段命名


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基因或片段的图案可以随意修改


此主题相关图片如下:
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好了!


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Here for adding a site


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来源:BioLover原创  人气: 编辑:hoyoyo

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